大量にzipファイルを作成する必要があり、コマンドラインからzipを作成する方法を調べました。
いろいろな情報・ソフトなどありますが、一番思いどおり動作してくれたものを紹介します。

ツールは、7-Zip　http://sevenzip.sourceforge.jp/ を使います。
コマンドは、

7z a test.zip folder\*

という感じ。
テクニックとして、

7z a test.zip folder\*

とかくと、test.zipの中のルートにfolder というフォルダができて、その中にファイルができるが、

7z a test.zip c:\batch\folder\*

とかくとフォルダ内のファイル群がルートになってくれます。

SCORMパッケージでzip作成するときに便利！